Историк, архитектор, реставратор Г. И. Гунькин родился 30 июня 1911 года в с. Подгорном Липецкого уезда Тамбовской губернии (ныне Липецкого района Липецкой области) в семье крестьянина. Окончил профшколу в Липецке (1928), Московский архитектурный институт (1939). Работал по специальности на станции Шлиссельбург Ленинградской области.
В 1943 году Г.И. Гунькин был призван в армию, но по состоянию здоровья через год был демобилизован. С 1945 года он работал в комитете по делам архитектуры при Совете министров РСФСР, с 1946 – младшим научным сотрудником Московского института истории искусств Академии наук СССР.
Изучая творчество архитектора В. И. Баженова, в том числе и на Липецкой земле, он опубликовал статью «О Церкви Знамения Божией Матери в с. Вешаловка Липецкого района» в фундаментальном труде «Неизвестные и предполагаемые работы Баженова», подготовленном под руководством историка искусств и художника И. Э. Грабаря (1951).
Им были выявлены и обследованы еще два предполагаемых творения Баженова в Данковском районе – Владимирская церковь в с. Баловнево и дворец Нечаевых-Мальцевых в с. Полибино.
С 1961 года ученый работал в Научно-методическом совете по охране памятников культуры при Министерстве культуры СССР, занимался реставрацией памятников архитектуры. Он провел исследования и обмеры памятников архитектуры Рязанской и Липецкой областей, участвовал в экспедициях Института археологии Академии наук СССР по исследованию античных городов Аполлония в Албании, Пантикапея (г. Kерчь) и Фанагории.
С 1966 года преподавал в Московском архитектурном институте, руководил студенческим проектно-конструкторским бюро, а с 1967 – и библиотекой института. В 1973-1983 годах – главный реставратор, затем главный консультант Академии художеств, занимался изучением неизвестных построек В. И. Баженова, боролся за восстановление Царицынского дворцово-паркового ансамбля.
Работы Г. И. Гунькина опубликованы в многотомном издании «История русского искусства» (том VI), в «Ежегоднике» Института истории искусств. Он выполнил иллюстрации в первых шести томах «Истории русского искусства», в третьем томе «Всеобщей истории искусств» (автор М. В. Алпатов), в книге «Рязань» (автор М. А. Ильин) и других изданиях.
Каждое лето Георгий Иванович приезжал в родные места, производил обследования и фотофиксацию памятников истории и архитектуры. Он внес большой вклад в организацию государственной охраны памятников истории и культуры Липецкой области, выявив сотни исторических зданий и сооружений области, оформил учетные карточки и паспорта к ним. Его труды сохраняют свое значение и в настоящее время.
Умер 29 декабря 1993 года.