История налоговых органов Липецкой области начинает свой отчет с 1990 года, когда в соответствии с приказом Министерства финансов от 21.02.1990 №12-А вновь созданную службу возглавил Владимир Иванович Бербенец – экономист образованию, имеющий большой опыт работы в финансовых органах.

К концу 1990 года в области функцонировали 6 городских и 18 районных инспекций.

Была сформирована система контроля и надзора за соблюдением налогового законодательства РФ о налогах и сборах, введено декларирование доходов физических лиц, созданы отделы информатизации, введены следующие налоги: налог на добавленную стоимость (НДС), акцизы, налоги на имущество предприятий и физических лиц, подоходный налог. Утвержден порядок ведения единого государственного реестра налогоплательщиков, в налоговых органах введена электронная почта, службе переданы функции лицензирования деятельности по производству и обороту этилового спирта и алкогольной продукции, контроль за производством и оборотом спирта и алкогольной продукции. 

Начало третьего тысячелетия для налоговой службы было ознаменовано введением транспортного налога, единого социального налога (ЕСН), внедрением «системы электронной обработки данных», обеспечением налогоплательщикам возможности предоставления форм налоговой и бухгалтерской отчетности по телекоммуникационным каналам связи. Были приняты законы о налогообложении прибыли, налог на добычу полезных ископаемых (НДПИ), развернута кампания массового присвоения ИНН физическим лицам, начато ведение федерального информационного ресурса Единый государственный реестр юридических лиц (ЕГРЮЛ), организован удаленный доступ к федеральному ресурсу – Единому государственному реестру недвижимости (ЕГРН) и внедрен Интернет-сайт www.nalog.ru.

Владимир Иванович Бербенец бессменно руководил налоговой службой области 20 лет. Его вклад в развитие налоговых органов России отмечен наградами. Будучи руководителем областного налогового ведомства, он получил звание «Заслуженный экономист Российской Федерации».

За время существования Управления его возглавляли следующие руководители : Екатерина Викторовна Макарова (2010-2013), Борис Петрович Хижняков (2013-2016), Станислав Вадимович Гусев (2017-2021).

В апреле 2022 года коллектив УФНС России по Липецкой области возглавил Валерий Николаевич Котляров.

За последние годы Федеральная налоговая служба претерпела серьезные изменения. Они коснулись как инновационной и технологической составляющей деятельности, так и принципов взаимодействия с налогоплательщиками. Изменение подхода к проведению мероприятий налогового контроля, человекоцентричность, информационная открытость, модернизация сервисных возможностей стали приоритетными направлениями. Служба стремимся максимально обеспечить понятность и предсказуемость деятельности налоговых органов, повысить доступность открытых информационных ресурсов для граждан, а также качество предоставления услуг.